Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms