Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms