Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCNN1GP51170 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCNN1GP51170 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCNN1GP51170 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCNN1GP51170 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCNN1GP51170 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms