Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms