Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms