Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 JCAD-201ENST00000375377 9265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms