Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GZMBP10144 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
GZMBP10144 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
GZMBP10144 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
GZMBP10144 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
GZMBP10144 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
GZMBP10144 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GZMBP10144 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms