Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KCNIP3Q9Y2W7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms