Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRIT1Q9P2V4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRIT1Q9P2V4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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