Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CALCOCO1Q9P1Z2 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CALCOCO1Q9P1Z2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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