Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms