Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIRT1Q96EB6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms