Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C18orf8Q96DM3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C18orf8Q96DM3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C18orf8Q96DM3 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C18orf8Q96DM3 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C18orf8Q96DM3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C18orf8Q96DM3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C18orf8Q96DM3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C18orf8Q96DM3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C18orf8Q96DM3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms