Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms