Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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