Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC4Q5GLZ8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms