Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RFTN2Q52LD8 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RFTN2Q52LD8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RFTN2Q52LD8 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RFTN2Q52LD8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RFTN2Q52LD8 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RFTN2Q52LD8 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RFTN2Q52LD8 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RFTN2Q52LD8 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RFTN2Q52LD8 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RFTN2Q52LD8 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RFTN2Q52LD8 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RFTN2Q52LD8 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RFTN2Q52LD8 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RFTN2Q52LD8 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RFTN2Q52LD8 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RFTN2Q52LD8 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms