Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms