Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX3P78415 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms