Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms