Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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