Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 FAM231B-201ENST00000600179 510 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 ZNF415-221ENST00000600574 563 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 LCN12-202ENST00000371633 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 SNAPC5-207ENST00000566658 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 AL512488.1-201ENST00000433544 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 AC093627.3-201ENST00000467050 574 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NESP48681 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 MBL3P-201ENST00000402234 644 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 AP000281.2-201ENST00000427911 384 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 GH2-205ENST00000622506 702 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NESP48681 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 HIST1H2BN-201ENST00000396980 432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 AC006987.4-201ENST00000430032 279 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NESP48681 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms