Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 HTR3B-201ENST00000260191 2011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC131888.1-201ENST00000625028 2168 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms