Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLTBP09497 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLTBP09497 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLTBP09497 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLTBP09497 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLTBP09497 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLTBP09497 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLTBP09497 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLTBP09497 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CLTBP09497 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLTBP09497 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CLTBP09497 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CLTBP09497 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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CLTBP09497 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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CLTBP09497 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLTBP09497 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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