Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYCNP04198 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCNP04198 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCNP04198 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCNP04198 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCNP04198 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCNP04198 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCNP04198 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCNP04198 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCNP04198 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
MYCNP04198 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 SPATA7-201ENST00000045347 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 RELL1-202ENST00000454158 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 OR5D14-201ENST00000335605 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 FCER1A-202ENST00000368115 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 KRTAP3-3-201ENST00000391586 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AL450309.1-201ENST00000423792 656 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AC023590.1-203ENST00000449065 411 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AP005482.3-201ENST00000585877 720 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AL450332.1-203ENST00000638742 1268 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYCNP04198 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCNP04198 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms