Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPINC1P01008 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPINC1P01008 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms