Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZBED1O96006 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZBED1O96006 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZBED1O96006 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZBED1O96006 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZBED1O96006 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZBED1O96006 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZBED1O96006 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ZBED1O96006 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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ZBED1O96006 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZBED1O96006 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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