Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGAP28Q9P2N2 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms