Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms