Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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CUL3Q13618 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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CUL3Q13618 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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CUL3Q13618 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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CUL3Q13618 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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CUL3Q13618 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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CUL3Q13618 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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CUL3Q13618 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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