Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 NDRG1-229ENST00000537882 2975 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 EPHB1-211ENST00000493838 2786 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 UBA3-202ENST00000361055 2154 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC087741.1-201ENST00000570309 4399 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CDH5-208ENST00000614547 3779 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC009060.1-202ENST00000502126 2242 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC239800.2-201ENST00000443018 2675 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 BCL6-202ENST00000406870 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AL590483.3-201ENST00000623669 3580 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MAN1C1-202ENST00000374329 2461 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC020912.1-201ENST00000638312 5059 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 EMG1-202ENST00000599672 4898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 PTGER3-206ENST00000370924 6982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TDRD3-201ENST00000196169 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ETFDH-206ENST00000511912 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CYP2B6-201ENST00000324071 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ANKLE2-208ENST00000542282 3302 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ZNF423-205ENST00000562871 4514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CYP1A1-201ENST00000379727 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TSPAN2-202ENST00000369516 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TAF1C-201ENST00000341690 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 DRC1-201ENST00000288710 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 PRKCQ-202ENST00000397176 3096 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TBX19-201ENST00000367821 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AP1B1-205ENST00000415447 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TBC1D3B-202ENST00000611257 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ATP2A1-203ENST00000536376 3130 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TRPC3-205ENST00000513531 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 IL36RN-201ENST00000346807 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms