Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JAG1P78504 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JAG1P78504 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms