Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPL23P62829 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPL23P62829 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms