Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP46P62068 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms