Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRPF1P55201 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms