Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KDM5AP29375 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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