Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms