Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNA2P20248 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms