Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms