Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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