Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms