Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-2B6SEH9 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms