Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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ARL2-SNX15V9GYD0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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ARL2-SNX15V9GYD0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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ARL2-SNX15V9GYD0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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ARL2-SNX15V9GYD0 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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ARL2-SNX15V9GYD0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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