Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SMG5Q9UPR3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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