Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms