Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BCO2Q9BYV7 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms