Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms