Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP13Q92995 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP13Q92995 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms