Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms