Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXP7

KIAA1644, Uncharacterized protein KIAA1644, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1644Q3SXP7 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KIAA1644Q3SXP7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms